تتولى مديرية النوعية والمختبرات وسلامة المياه من خلال وحدة توكيد الجودة تطبيق نظام الجودة وفقا لمتطلبات المواصفة القياسية الدولية "المتطلبات العامة لمختبرات الفحص والمعايرة" (ISO /IEC 17025) وتنفيذ دليل نظام الجودة للمديرية، وتدقيق اجراءات العمل بما يتطابق مع هذا الدليل واجراء التطوير المستمر على نظام الجودة. وقد حصلت المديرية على الاعتماد الدولي من قبل هيئة الاعتماد البريطاني United Kingdom Accreditation Service (UKAS) منذ عام 2010 وتم تجديد الاعتماد في عام 2014 وبتاريخ 31/05/2018 تم إيقاف الاعتماد من الهيئة المذكورة بعد حصول وحدة الاعتماد الأردني - نظام الاعتماد والتقييس الأردني (JAS-AU) على الاعتراف الدولي من هيئة التعاون الدولي لاعتماد المختبرات International Laboratory Accreditation Cooperation (ILAC)، وبناءً على ذلك فان جميع الفحوصات المعتمدة من قبل وحدة الاعتماد اصبحت معتمدة دولياً علماً بأن المديرية قد حصلت على الاعتماد لمختبرات الفحص من قبل وحدة الاعتماد حسب مواصفة 17025 ISO /IEC منذ عام 2006 وتم تجديد الاعتماد في عامي 2011 و 2016.

تم نيل هذا الاعتماد بجهود متخصصة وموظفين مؤهلين وباستخدام أحدث التقنيات وفقا لطرق اختبار معتمدة عالمياً لتحاليل مياه الشرب والمياه العادمة وذلك لإخراج نتائج موثوق بها وبدقة عالية لغايات اتخاذ القرار بشأن نوعية المياه والمطابقة للمعايير الدولية والوطنية.

وفيما يلي اخر تحديث على شهادات الإعتماد التي حصلت عليها المديرية: